海洋經濟運行監測與評估業務主要通過數據采集、匯總分析，實現省級節點、市級節點組織開展，負責依據海洋經濟監測數據對省、市、縣三級行政區域的海洋經濟活動進行評估。省級節點負責評估省級及所轄市級行政區域海洋經濟狀況評估，市級節點負責所轄縣級行政區域海洋經濟評估。省市級節點要通過海洋專網對所轄市縣節點進行海洋經濟評估成果的反饋。

系統應利用各沿海地區海洋經濟監測數據及其他相關數據，為對海洋經濟、新興產業、主導海洋產業競爭力、海洋經濟影響因素和重大事件的影響提供輔助分析，由省級海洋主管部門負責評估全省海洋經濟運行狀況。系統實現了對海洋經濟重點企業原始統計數據直接聯網報送， 提高海洋統計數據時效性， 擴充監測指標和內容， 增加投資、出口、經營狀況、資源與能源消耗、企業的生產活動及生產要素等類指標，增強海洋經濟信息的采集和監測能力， 提升海洋經濟管理的信息化水平， 提高海洋經濟評估產品深度， 實現范圍覆蓋省、沿海市、縣區及個工業園區三個層級，增強對海洋經濟管理與政策咨詢的服務能力。